元谋县位于云南省中部，地理位置十分优越。整个县境南部是滇东南山地区，北部则是东亚热带季风气候区，使得元谋县拥有多样的地理海拔特点。

元谋县的平均海拔约在1300米左右，最高处为云岭山脉的主峰，海拔高达3066米，气候凉爽，适宜农作物生长，是农业发达地区。

由于地势起伏较大，元谋县内分布着多条河流，如元江、澜沧江、南盘江等，为当地居民提供了丰富的水资源。

另外，县内还有多个自然保护区和森林公园，如南澜沧江自然保护区、元谋野象谷等，拥有丰富的自然资源和独特的地理景观。