车辆工程与机械设计制造及其自动化都是与机械相关的学科，但它们在研究内容和应用方向上存在一定的区别。

车辆工程主要研究汽车、摩托车和其他交通工具的设计、制造、运行和维护等方面的问题。该学科涉及到机械、电子、材料等多个领域的知识，旨在培养学生掌握车辆工程技术的理论和实践能力，以适应现代交通运输的需要。车辆工程的重点在于研究交通工具的性能提升、节能减排、安全性与可靠性等方面的技术创新。

而机械设计制造及其自动化则更加广泛，它研究的是机械产品的设计、制造、运行和自动化控制等方面的问题。机械设计制造及其自动化除了涉及传统机械产品，还包括机械电子一体化产品、机电一体化设备等。该学科的培养目标是使学生具备扎实的机械设计和制造基础知识，掌握自动化控制技术，具备解决实际工程问题的能力。

从应用角度来看，车辆工程更加注重交通工具的研发和应用，着眼点更多地集中在交通运输领域。而机械设计制造及其自动化则广泛运用于制造业的各个领域，例如机械制造、航空航天、化工等。机械设计制造及其自动化的应用范围更广泛，涉及到的行业和领域更加多样化。

总体来说，车辆工程与机械设计制造及其自动化在研究内容和应用方向上存在一定的区别。车辆工程主要研究交通工具的设计与性能优化，机械设计制造及其自动化则涉及更广泛的机械产品设计与制造。这两个学科有着不同的研究重点和应用领域，但都对培养具备专业技术和工程实践能力的人才起到了至关重要的作用。