1. 签订补偿协议时，首先需要注意协议的具体内容。补偿协议是一种法律文书，因此需要明确双方的权利与义务、补偿金额、补偿方式等具体细节。双方应详细讨论并确认这些内容，确保协议的准确性和合法性。

2. 双方在签订补偿协议之前，应该对协议的约束力进行明确。包括补偿协议的有效期限、是否可撤销或修改等事项。这些内容有助于保障双方的权益，防止协议发生争议或误解。

3. 协议的签订应该以双方真实意愿为基础，不得违反法律法规。双方在签订协议前要确保对相关法律法规的了解，并保证协议内容的合法性。如有需要，可以请专业律师进行评审和咨询。

4. 签订补偿协议时，双方应当保留好相关证据。协议的签字、日期等信息应当被妥善保存，以备日后需要核对和证明。

5. 在签订协议之前，双方要做详细的调查与研究。特别是对于涉及到资金或者财务方面的协议，需要核实双方的资产情况，以便明确补偿金额的合理性和可行性。

总结：签订补偿协议时，双方要注意协议内容的准确性、约束力的明确、合法性的保证、证据的保存以及调查的详细性。通过认真应对上述问题，才能保证协议的有效性，维护双方的权益。